Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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