Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNXAQ16473 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNXAQ16473 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TNXAQ16473 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNXAQ16473 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNXAQ16473 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms