Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB3Q15768 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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