Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSU1Q15404 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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