Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PDK1Q15118 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK1Q15118 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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