Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms