Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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