Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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