Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSPNQ14714 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSPNQ14714 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms