Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM25Q14258 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms