Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms