Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOFQ13790 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms