Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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CDH18Q13634 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH18Q13634 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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