Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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