Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TUBB3Q13509 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB3Q13509 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms