Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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