Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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