Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR5A1Q13285 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR5A1Q13285 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR5A1Q13285 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR5A1Q13285 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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