Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIN2BQ13224 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
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