Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms