Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FOXF1Q12946 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF1Q12946 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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