Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 14.2
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ILF3Q12906 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 38.6□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 SORT1-203ENST00000471996 469 ntTSL 319.04■□□□□ 0.641e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 MARCH7-205ENST00000421037 559 ntTSL 413.89□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 14.2
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ILF3Q12906 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.923e-6■■□□□ 14.2
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ILF3Q12906 PUM1-209ENST00000480602 906 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PUM1-218ENST00000526215 586 ntTSL 26.46□□□□□ -1.384e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 NBPF11-203ENST00000614506 5152 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 310.71□□□□□ -0.693e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 CTNND1-209ENST00000524579 505 ntTSL 44.64□□□□□ -1.673e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.194e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 320.97■□□□□ 0.954e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 420.97■□□□□ 0.954e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 516.9■□□□□ 0.34e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 215.98■□□□□ 0.154e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 415.51■□□□□ 0.074e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 CD276-210ENST00000560928 2181 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 211.38□□□□□ -0.594e-13■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PLCB1-223ENST00000635929 2291 ntTSL 58.79□□□□□ -13e-6■■□□□ 14.2
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ILF3Q12906 PLCB1-208ENST00000487210 4781 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.643e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 PLCB1-234ENST00000637935 3316 ntTSL 52.42□□□□□ -2.023e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TFRC-210ENST00000465288 560 ntTSL 58.61□□□□□ -1.035e-11■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TFRC-211ENST00000475593 875 ntTSL 35.89□□□□□ -1.475e-11■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TFRC-212ENST00000477148 570 ntTSL 45.55□□□□□ -1.525e-11■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-47■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-47■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-47■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-10■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 ZFAND6-221ENST00000564367 582 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-7■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ZFAND6-216ENST00000560470 558 ntTSL 49.34□□□□□ -0.911e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.011e-7■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-7■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 ZFAND6-209ENST00000558724 621 ntTSL 54.62□□□□□ -1.671e-7■■□□□ 14.1
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ILF3Q12906 ZFAND6-206ENST00000558390 566 ntTSL 44.14□□□□□ -1.751e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ZFAND6-202ENST00000557793 532 ntTSL 23.86□□□□□ -1.791e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ZFAND6-205ENST00000558272 583 ntTSL 33.79□□□□□ -1.81e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ZFAND6-215ENST00000560392 568 ntTSL 43.63□□□□□ -1.831e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 BMPR1A-202ENST00000480152 421 ntTSL 33.58□□□□□ -1.841e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 BMPR1A-203ENST00000635816 3238 ntTSL 53.54□□□□□ -1.841e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.881e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.547e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.247e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 213.49□□□□□ -0.257e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.467e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 323.27■■□□□ 1.321e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-203ENST00000421929 979 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-207ENST00000448782 975 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 59.36□□□□□ -0.911e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 14.1
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