Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNL1Q0VF96 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms