Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms