Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGM3Q08188 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms