Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFF3Q07654 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms