Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNDQ07001 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms