Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOX4Q06945 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SOX4Q06945 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms