Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms