Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKCDQ05655 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms