Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms