Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL10A1Q03692 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms