Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4A11Q02928 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms