Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUCB1Q02818 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms