Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OC90Q02509 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OC90Q02509 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OC90Q02509 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms