Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYP27A1Q02318 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms