Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BNC1Q01954 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms