Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC10Q01780 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms