Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms