Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCCQ00597 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms