Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms