Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPCAP84074 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms