Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX5P78411 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX5P78411 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX5P78411 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms