Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA52P62987 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms