Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPS16P62249 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS16P62249 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms