Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3S2P59780 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms