Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSX2P58304 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSX2P58304 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSX2P58304 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms