Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP4P57796 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP4P57796 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms