Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK4P57078 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK4P57078 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms