Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP9P55211 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms